Creado en 2017, tomando como base el laboratorio de patología (establecido en 1974) y la especialidad en patología bucal. Actualmente es un departamento que además de estar presente en el área de investigación básica, tiene alcances en el área de docencia y clínica, debido a que dentro de sus funciones se encuentra el generar y desarrollar conocimiento gracias a sus líneas de investigación, formar recursos humanos a nivel doctorado, maestría, así como especialistas en patología bucal, también presenta servicio de atención a pacientes en su clínica de medicina bucal y ser un centro de diagnóstico histopatológico de vanguardia.
El Departamento de Patologia y Medicina Bucal esta conformado por 4 áreas de trabajo:
- El servicio de diagnóstico histopatologico
- El area de inmunohistoquimica
- Especialidad de patologia bucal- Clinica de atencion a displasias orales