La Facultad de Odontología inició en 1904 sus actividades de enseñanza odontológica en las calles de la Escondida número 1 y 2, siendo en noviembre de 1916 cuando cambió de ubicación a una casa situada en Brasil número 35. En este lugar permanece
hasta 1935, siendo reubicada a un sublime edificio localizado en Lic. Primo Verdad esquina Guatemala. Finalmente, en 1958 se muda a sus nuevas y definitivas instalaciones en Ciudad Universitaria.

En sus inicios como Consultorio Nacional de Enseñanza Dental, contaba con siete profesores y seis alumnos. A partir de los años 70, se dio un incremento constante en la matrícula estudiantil hasta alcanzar, en 1980, su máximo registro con 5,678 alumnos y 883 docentes. Actualmente está conformada por 3,375 estudiantes y 686 académicos.

En 1972, en la Escuela Nacional de Odontología se disponía de 13 clínicas para dar servicio dental al público y con 11,209m2 de superficie construida. Actualmente, la infraestructura del edificio principal, que sustenta la labor docente, lo constituyen 15 clínicas con 382 unidades dentales, 15 aparatos de rayos X, un ortopantomógrafo, 81 simuladores preclínicos, nueve laboratorios, 15 aulas, tres aulas-laboratorio, dos laboratorios de cómputo, una mediateca, una sala de videoconferencias y una biblioteca, entre otras áreas, con una superficie construida de 31,606 m2, que junto con la de posgrado -5,887- y clínicas periféricas -8,609- representa un total de 46,102m2.